近日,云南省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)研發(fā)與應(yīng)用省創(chuàng)新團(tuán)隊在云南省科技廳重大科技專項計劃、省基礎(chǔ)研究計劃、國家自然科學(xué)基金等項目的支持下,成功研發(fā)云上黑山羊基因身份證和云上黑山羊50K育種芯片。
作為云南省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院自主研發(fā)、具有自有知識產(chǎn)權(quán)的檢測手段,不但可以開展國家級主導(dǎo)品種——云上黑山羊的精準(zhǔn)鑒定,而且能夠提高云上黑山羊精準(zhǔn)育種水平和育種效率,為規(guī)范云上黑山羊種羊推廣、提高云上黑山羊種質(zhì)價值、開展云上黑山羊持續(xù)選育提高提供核心技術(shù)支撐,對發(fā)展新質(zhì)生產(chǎn)力,促進(jìn)我省肉羊產(chǎn)業(yè)高質(zhì)量發(fā)展具有重要推動作用。
(云上黑山羊基因身份證)
為了鑒定云上黑山羊純種,有效開展種業(yè)市場監(jiān)管,維護(hù)云上黑山羊的品牌價值,云南省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院研究團(tuán)隊對中國南方主要的4個黑山羊品種(類群)160只個體進(jìn)行深度基因組重測序獲取各品種特異性位點后,利用Mass Array分子檢測平臺對3072個樣本進(jìn)行分型檢測,借助機(jī)器學(xué)習(xí)方法建立了云上黑山羊鑒定模型并完成模型的優(yōu)化,挖掘出能夠作為純種云上黑山羊基因標(biāo)識鑒定的26個SNP位點,最終研發(fā)出云上黑山羊基因身份證,目前該基因身份證鑒定成功率達(dá)90%,是國內(nèi)唯一開展云上黑山羊品種鑒定的試劑盒。
(云上黑山羊50K育種芯片)
云上黑山羊50K育種芯片,基于山羊通用芯片功能位點,融合了74個云上黑山羊繁殖性狀、生長性狀和基因身份證的功能位點共計50000個SNP位點,平均檢出率可達(dá)98.77%,分型一致性可達(dá)99.30%,相較于通用芯片檢測成本降低30.91%。該芯片不但可用于云上黑山羊全基因組選擇育種、重要經(jīng)濟(jì)性狀功能基因挖掘,還可用于云南本地山羊種質(zhì)資源創(chuàng)新利用與保護(hù)、親緣關(guān)系鑒定等,是目前國內(nèi)唯一一款云上黑山羊育種芯片,相較通用芯片,在降低分子育種成本、提高選種準(zhǔn)確率方面優(yōu)勢明顯。(云南省科學(xué)技術(shù)廳 云南省畜牧獸醫(yī)科學(xué)院供稿)
(責(zé)任編輯:孟君君)